一份苹果研究说某基因在花中表达较高,是否就意味着花的每个部分都有同样表现?Yao等2018年的论文对Royal Gala苹果作了更细的比较:整花中的MdPI转录水平较高,而分出的花被筒中,MdPI却近乎不可检出。理解这个结果,关键在于两次“花组织”指向的材料范围不同。[1]
整花比较先给出发育背景。MdPI在花蕾的气球期和开放花中表现出较高转录水平,授粉后早期果实中的水平大幅降低,随后到成熟阶段的所查果实中未检出。这里记录的是某些组织与时期的转录活动;它没有说MdPI从苹果的基因组里被删去了,也没有给任何果实提供采收时间判断。[1]
为了继续辨认空间分布,作者把Royal Gala花分成两种组织。一组是花被筒,原文说明其中已移去子房组织;另一组则是从花被筒分离出来后合在一起的萼片、花瓣、雄蕊及子房组织。后一组仍由多个器官组成,并不是单独一片花瓣。先弄清这项组合,才知道随后较高或较低的表达究竟在哪里被观察到。[1]
在花部合组中,MdPI、MdMADS13与MdTM6在花蕾期较高,到开花及授粉后早期下降。花被筒的情况不同:从花蕾气球期到所查的授粉后阶段,MdPI与MdTM6近乎不可检出,MdMADS13则以很低水平被检测到。因此,整花的高表达与花被筒的低表达可以同时成立;前者并没有要求组成整花的每一种组织都保持同样水平。[1]
论文还保留了一项结构假说背景:花被筒被认为由萼片、花瓣和雄蕊的基部融合而成,但作者仍在其中观察到较弱的B功能基因表达。这个对照说明,讨论组织来源与报告当前表达分布,是相连但不同的工作。本文没有把结构假说升级为全部发育过程已获直接证明,也不据低表达否定花被筒的组织来源。[1]
另一个背景是基因拷贝。作者在苹果基因组中识别到单个PI同源基因MdPI,而许多花器官基因在较近的全基因组重复后常有两份旁系同源拷贝。原文提出重复后染色体片段丢失可能解释MdPI的单拷贝状态,语气仍是可能。这项基因组层面的数量,与前述不同部位的转录水平,不能混成同一项观察。[1]
上述表达分析使用Royal Gala;论文其他操纵实验使用Bolero,作者要求解释不同品种数据时保留一定谨慎。本篇只采用原生材料的组织表达与相邻背景,不转述操纵步骤或果形改造结果。对于苹果研究资料整理,具体收获是把整花、花部合组与花被筒分别写清,再解释表达的时间与位置。来源发表于2018年4月14日,本文未从图表另取数值,也不提供育种或品质保证。[1]
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